Le protiste peut alors garder le chloroplaste ou la cyanelle de sa proie et redevenir un végétal.
Les relations sont d’autant plus complexes que les zooxanthelles ne sont pas les seuls partenaires de cette symbiose : le corail est en fait une véritable HLM hébergeant de nombreux partenaires, bactéries, virus, protistes, champignons qui constituent un microbiote dont le rôle commence à peine à être ébauché.