Les propriétés physiques de la roche, et notamment sa perméabilité pour les eaux filtrantes, sont également à l'origine des phénomènes de dissolution calcaire et, ultérieurement, des transformations chimiques et minéralogiques du sol. Cette altération chimique inclut en effet trois étapes principales, et comprend successivement une décarbonatation, une rubéfaction et une décalcification. Cette évolution va de pair avec un changement de couleur, qui passe du lithochrome à des teintes brunes, puis rouges.
En effet, la variégation, la rubéfaction et l’argyrescence qui tous les trois panachent le feuillage des plantes, sont trois phénomènes d'un ordre parfaitement distinct et qui n'ont en commun que la propriété de modifier le coloris des feuilles.
Dans les feuilles de Lierre, la rubéfaction, le plus souvent peu intense, ne se produit que par taches, et épargne une certaine zone de parenchyme autour des nervures. Elle est plus vive dans celles de Mahonia, dont elle finit par envahir tout le limbe, après avoir d'abord apparue au sommet.